Souffrant toujours d'amnésie, Bourne a enterré son passé violent et vit tranquillement avec sa compagne Marie. Mais son existence paisible vole en éclats quand il est victime d'une tentative d'assassinat. Pourchassé par un mystérieux ennemi, Bourne prouve encore une fois qu'il n'est ni une cible facile, ni un homme dont on peut sous-estimer la valeur et la résistance.