Le chaos règne sur Tsushima : un immense spécimen s'est réveillé, menaçant l'ensemble de l'archipel. Le commandant Kusagae, qui a retrouvé Misaki, fait face à son ancien supérieur désormais corrompu par l'IAS. Incapable d'être gigantisé suite à une ruse de ses adversaires, Gen doit parvenir à déclencher malgré tout sa mutation pour espérer soumettre son adversaire et ainsi sauver sœur. Car sansle Gigantis, le destin de Tsushima et du Japon tout entier est d'êrte anéanti… L'espoir est-il encore permis ? Découvrez l'issue de cette tragédie mêlant survival et science-fiction !

Rescapé de Tsushima, le jeune Gen est l'objet de toutes les convoitises. Tandis que le commandant Kusagae implore son aide pour venger ses camarades sacrifiés, Rin Samura souhaite l'intégrer, de gré ou de force, au projet Gigantis. Mais le garçon n'a qu'une obsession : arracher sa soeur à l'enfer. Hélas, tous semblent oublier le plus grave... jusque-là miraculeusement protégé de la menace IAS, le Japon est sur le point de basculer dans le chaos !