Dans un Japon mi-médiéval mi-futuriste, des extraterrestres, les Amanto, débarquent sur Terre. Forts de leur supériorité technologique, ils vont imposer leur loi : tout samourai devra se défaire de son sabre, donc de son âme de guerrier. C'est compter sans Gintoki Sakata. Armé de son sabre d'entraînement, il se placera en dernier défenseur du bushido, le code du samourai.