Sumimura Yoshimori et sa voisine Yukimura Tokine sont collégiens et la nuit, chasseurs d'êtres surnaturels. Ils descendent tous deux de Kekkaishi, mais leurs familles s'affrontent depuis longtemps pour affirmer leur légitimité. Les deux amis qui combattent les forces maléfiques, attirés par le domaine des Karasumori, doivent faire face à l'arrivée de la redoutable Yomi.