Thomas l'Aristoloche est élève de sixième dans un collège parisien. Persuadé d'être le descendant d'un grand explorateur, il passe son temps à ramasser des plantes. C'est le professeur Potard, éminent botaniste, qui lui a appris à les identifier et à en connaître les secrets. Thomas et son copain, Gaspard, essayent de résoudre une histoire d'empoisonnements en série.