Le protecteur de Gotham et les quatre Chevaliers d'écailles font équipe pour nous proposer une rencontre inattendue mais non moins explosive ! Enquêtant sur de mystérieux assassinats à Gotham, Batman découvre l'existence d'un groupe de super ninjas appelé le clan des Foot. Venus d'une autre dimension, ces experts du Ninjutsu comptent bien ravager la ville du Chevalier Noir. Mais ils ne sont pas arrivés seuls : les quatre Tortues Ninja, Leonardo, Raphael, Donatello et Michelangelo, les ont pris en chasse. Une rencontre épique entre deux dimensions, deux visions de l'héroïsme et deux visions du chaos qui vont s'entrechoquer dans un combat qui menace le tissu même de la réalité.

La patrouille de Batman sur Gotham s'achève. Il rentre à la Batcav. Mais à la place d'Alfred, c'est Splinter qui l'attend. Au lieu de Nightwing, Red Hood, Tim Drake et Damian Wayne, il se retrouve nez à nez avec Leonardo, Raphael, Donatello et Michelangelo. L'aventure commence et leurs ennemis s'avèrent être l'hybride de Shredder et du Joker, Krang vivant désormais dans l'Anti-Monitor.