Sumimura Yoshimori et sa voisine Yukimura sont collégiens mais la nuit ils sont chasseurs d'êtres surnaturels. Une très vieille rivalité déchire leur famille et l'héritage de Kekkaishi est en jeu. Les héritiers doivent protéger le château des seigneurs Karasumori. Yoshimori poursuit son entraînement. Grâce à Tokine, il trouve de nouvelles propriétés aux kekkai et s'efforce de les utiliser.