Quinze ans après le tremblement de terre qui a entraîné la division du Japon, les réfugiés éparpillés dans le monde ne peuvent toujours pas rentrer chez eux. Ne bénéficiant que de droits limités, une partie de ces réfugiés a décidé de se révolter et de mener des actions terroristes. Gen'ichir, un jeune amnésique, a découvert qu'un étrange complot se tramait derrière ces mouvements terroristes.

Au nom de la réunification du Japon, le Premier ministre du Nord, Takuya Todo, monte patiemment une force armée. Face à cette menace, Misao Munakata, qui souhaite toujours l'indépendance du Sud, se décide à le faire assassiner...

Avec le début de son mandat de sous-préfet, Minakata commence à mettre en place des actions pour l'indépendance du Sud dans le but d'en faire un Etat libre. C'est alors qu'il fait la connaissance de Charles Zola, chef de la commission d'enquête de l'ONU. Mais un groupe de rebelles souhaite le faire assassiner par Gen'ichiro.

Suguro, le meurtrier de Todo, doit être jugé lorsqu'il sera rétabli de sa blessure. Mago'ichi et Gen'ichiro veulent profiter du procès pour rendre publique l'existence de la Grande Ourse, volet occulte du gouvernement Todo. Mais Suguro disparaît avec des soldats d'élite et abat l'un après l'autre les membres de la Grande Ourse.

Manékata prend la tête de l'administration. Il a vu mourir sous ses yeux sa bien-aimée Eri. Cette terrible expérience a fini de figer le peu d'humanité qu'il lui restait. Il est désormais prêt à tout pour obtenir le pouvoir. Pendant ce temps, Gen'ichiro et ses amis ont manqué leur fuite du Japon. Mais sur l'île où ils ont échoué, un fabuleux destin les attend.

Munakata a signé un accord de cessez-le-feu entre le Nord et le Sud. Cet arrangement portera également sur le contrat concernant l'exploitation de l'énergie M du bras de mer. Mais les choses se compliquent car en plus de l'indépendance du Sud, Munakata vise aussi la libération d'Eri, plus connu comme Isayoi, gourou de la secte de la 16e lune.

Au milieu des conflits et des manoeuvres politiques qui secouent les deux parties du Japon, une lueur d'espoir apparaît enfin. Il est temps pour Gen'Ichiro de renouer avec ses origines et de prendre ses responsabilités. Le jeune rebelle idéaliste doit s'effacer pour laisser place au politicien qui sommeille en lui.

Misao Munokata s'est installé avec Eri à Fukuoka, la capitale du Japon du Sud. Il entend parler du plan Rockwell, un projet de formation des jeunes Japonais aux Etats-Unis afin de recréer les forces vives du Japon. Il s'y présente, part étudier à Harvard et revient dix plus tard...

Après la reconnaissance de l'état indépendant, l'immigration clandestine s'est développée entre les frontières du nord et du sud. C'est dans ce contexte que Misao Munakata, qui occupe désormais un poste très important sur le territoire du sud, revient au pays. Il a pour objectif de créer un nouveau Japon. Pour obtenir son poste actuel, il a dû cependant renoncer à Erine, sa petite amie.

Désirant mieux comprendre le fonctionnement du Nord Japon et souhaitant retrouver son grand-père, Gen'ichiro part pour Yokohama. Il rencontre les dirigeants de l'Alliance du Bras de mer et découvre les raisons qui ont poussé son leader actuel à rejoindre un groupe de lutte armée pour aider son pays à sortir de la crise.

Takuya Todo est parvenu au pouvoir après le faux coup d'Etat qu'il a organisé avec Buicho Suguro de l'armée d'autodéfense nord-japonaise et la mort du Premier ministre Mabuchi et de Takuma Ryu, le grand-père de Gen'ichiro. Le jeune homme s'allie à l'Alliance du bras de mer pour lutter contre Todo.

Après le coup d'éclat du colonel Suguro, Gen'Ichiro et ses amis se retrouvent en mauvaise posture. Alors qu'ils pensaient avoir contraint le gouvernement du Nord-Japon à organiser des élections, la Chine envoie un nouveau représentant. Les choses se compliquent et les intérêts divergent...

Les terroristes de Kurofuji ont pris en otage la chaîne d'information TCB pour faire entendre leur message et sont allés jusqu'à abattre un homme sous l'oeil des caméras. Pourtant le jeune Gen'Ichiro semble persuadé du bien fondé des propos de M. Ozu et tente de raisonner Kurofuji. L'évènement prend une tournure innatendue et c'est le gouvernement de Taïwan qui se trouve ébranlé.

A Taïwan, les habitants du camp provisoire Tansui sont encore victimes de discriminations et d'injustices. Alors qu'une révolte est sur le point d'éclater, deux hommes vont essayer d'empêcher le bain de sang. Chan, un membre de la mafia taïwanaise, est aidé par un vendeur de nouilles, Shan, adopté quinze ans plus tôt par un couple de Taïwanais alors qu'il se trouvait sur les rives du lac Biwa.