Suite à la perte de leur satellite de frappe et au vol de leurs données par U.N., N.I.N. se retrouve brusquement en position de faiblesse. Traqués par les nouveaux modèles de drone-shuriken de l'ennemi, tous les gradés sont obligés de se terrer et les genin sont envoyés en première ligne. De son côté, Katô est condamné à mort par la cour martiale ninja après l'échec de l'opération au lycée Kôdan...