Dans la nuit du 11 au 12 juin 1999, un violent incendie a ravagé les locaux historiques de l'université Lyon 2 sur le quai Claude-Bernard, détruisant irrémédiablement plus de 60% des collections de la bibliothèque centrale commune aux universités de Lyon 2 et de Lyon 3.

Le service commun de la documentation (SCD) de l'université de Lyon 3 propose divers services sur le réseau de l'université à l'ensemble des bibliothèques intégrées et associées réparties sur trois sites.