Depuis la révocation de l'édit de Nantes protestants n'ont plus le droit d'exercer la médecine et la chirurgie. Alexandre Olivier Oexmelin, qui voit sa vocation de chirurgien brisée, décide de signer un engagement de trois ans avec la Compagnie des Indes occidentales à destination de l'île de la Tortue. Il raconte ses aventures avec les flibustiers et les boucaniers.