A travers plus de deux cents pièces (dont certaines ne sont même pas exposées en Turquie), le parcours rompt ainsi avec la sempiternelle présentation chronologique pour tenter de cerner ce qui constitue la colonne vertébrale des civilisations qui se sont succédé sur cette même terre : la conception du cosmos, le rapport à la nature, le monde des dieux, l'intervention du sacré dans le monde profane.