Sumimura Yoshimori et sa voisine Yukimura Tokine sont collégiens et, la nuit, chasseurs d'êtres surnaturels. Ils descendent tous deux de Kekkaishi, mais leurs familles s'affrontent depuis longtemps pour affirmer leur légitimité. Les deux amis combattent les forces maléfiques, attirées par le domaine des Karasumori.