Tchao a lancé son sort de reconnaissance de la magie sur le monde entier et Negi, qui a été incapable de l'arrêter, est condamné à être transformé en hermine. Asuna, Setsuna et d'autres élèves viennent à la rescousse de leur professeur et prennent pour cela tous les risques. Leur seule chance est d'utiliser une dernière fois Cassiopée et remonter le temps...