En 1803, dans la baie de Tripoli, une bataille s'engage entre l'Intrepid et le Saqr, le navire du pirate Suleiman al-Jama. Le combat risque d'engloutir le trésor des pirates. De nos jours, la CIA envoie Juan Cabrillo enquêter en Libye sur le crash de l'avion de la secrétaire d'Etat, partie pour un sommet sur la paix. Il se rend compte que la secrétaire n'apparaît pas parmi les victimes.