La carrière de footballeur de Yoichi Isagi, un lycéen, semble s'achever prématurément lorsque son équipe perd à la dernière minute le match de qualification pour le championnat national et que sa chance d'être découvert en tant que jeune talent s'envole. Mais lorsqu'il rentre chez lui après le match, une lettre l'attend : l'Association japonaise de football l'invite à un camp d'entraînement spécial ! Il devient rapidement évident que ce camp est en effet inhabituel, car tous les joueurs invités semblent être des attaquants. Un homme se présentant comme Jinpachi Ego apparaît sur scène et explique qu'il s'agit du projet BLUE LOCK, dont l'objectif est de créer au Japon un attaquant capable de se mesurer aux meilleurs du monde. Seul un participant sur 300 pourra s'imposer - celui qui sera éliminé sera exclu à vie du football professionnel...