Des articles publiés dans The New Yorker et dans le livre subséquent de Malcolm, The Freud Archives , ont déclenché une contestation judiciaire de 10 millions de dollars par le psychanalyste Jeffrey Moussaieff Masson , l'ancien directeur de projet des Archives Freud . Dans son procès de 1984, Masson a affirmé que Malcolm l'avait diffamé en fabriquant des citations qui lui étaient attribuées; ces citations, soutenait Masson, l'avaient discrédité.