Depuis que Charlie a le don d'entendre parler les photos, plus rien ne tourne rond. Fini la vie de garçon comme les autres. Si seulement il avait pu garder ça pour lui, il n'aurait pas été obligé d'aller dans une école sinistre, où se passent des choses plutôt inquiétantes. Que cachent ces ruines où une élève a disparu ? Qui est l'affreux Manfred Bloor aux yeux noirs ? Avec ses amis, Charlie a décidé de tirer cela au clair, au péril de sa vie.

La veille de la rentrée à l'Institut Bloor, les puissants ancêtres Bloor ont invoqué Borlath, un ancien guerrier, et attirent le jeune Billy en lui faisant miroiter une possible famille adoptive, qui se révèle vite être une prison. Charlie et ses amis s'opposent aux Bloor et délivrent Billy, aidés par le fantôme cheval.

Henry Yeldim, lointain ancêtre de Charlie, est propulsé de l'année 1916 à aujourd'hui par son cousin Ezekiel Bloor grâce à une bille magique. Henry se retrouve ainsi à l'institut Bloor à l'âge de 11 ans, poursuivi par Ezekiel qui, devenu centenaire, cherche à le faire disparaître. Charlie, aidé de Fidelio, Gabriel, Tancrède, Olivia, Emma et de son grand-oncle Vassili, va tenter de l'en empêcher.

Un élève s'est volatilisé dans le grenier de l'institut Bloor depuis un an. Charlie et ses amis sont décidés à le retrouver, mais le jeune disparu a été rendu invisible par un maléfique boa bleu. La grand-mère de Charlie a recueilli une nouvelle élève, la mystérieuse Belle. Charlie doit aussi s'occuper de son oncle Vassili, atteint d'un mal étrange.