Les Siths et les séides se sont voués à l'étude du côté obscur de la force. Dans leur quête de puissance, les Siths ne sauraient tolérer qu'un chevalier Jedi se mette en travers de leur chemin. Pourtant, Qui-Gon Jinn et Obi-Wan vont défier leur chef, le Docteur Lundi. Ce dernier est sur le point de créer un holocron. Après une première victoire, les Siths ne se laisseront pas défaire facilement.

Après la mort de Tahl, la chevalière Jedi, Qui-Gon est égaré par le chagrin et la colère. Il n'aura de cesse de retrouver l'assassin et de lui faire payer le meurtre de son amie. Mais Obi-Wan et Mace Windu, membres du conseil, redoutent que le jeune apprenti se laisse gagner par le côté obscur de la Force.

Qui-Gon, bouleversé par la mort de Tahl, accepte néanmoins une mission : protéger une jeune femme, Lena Cobral, censée témoigner devant le Sénat contre son propre camp. Elle souhaite dénoncer la corruption qui règne sur Frego, désormais gouvernée dans la violence par son beau-frère Solan. Mais les Jedi découvrent qu'elle ne possède aucune preuve.