La justice tente de localiser les fosses communes où sont enterrées les victimes des massacres des groupes paramilitaires d'extrême droite. Entre 10 000 et 30 000 personnes ont disparu depuis vingt ans.

Plusieurs affaires montrent que certaines unités de l'armée font disparaître des civils pour améliorer leurs statistiques de résultat dans leur combat contre les groupes armés

Depuis la fin 2006, le scandale de la "parapolitique" secoue la Colombie : les révélations se mulitplient sur les relations entre des membres de la classe politique ainsi que certains secteurs économiques et les tueurs d'extrême droite des Auto-défenses unies de Colombie (AUC).